movie.mp4に日本語字幕jpn.vttと英語字幕eng.vttを埋め込んだout.mp4を作成するコマンド。
ffmpeg -i 'movie.mp4' -i 'jpn.vtt' -i 'eng.vtt' \
-map 0:v -map 0:a -map 1 -map 2 \
-c:v copy -c:a copy -c:s mov_text \
-metadata:s:s:0 language=jpn \
-metadata:s:s:1 language=eng \
out.mp4